Alla collezione appartiene un nutrito nucleo di medaglie appartenuto già al fondatore e incrementato notevolmente grazie alle donazioni di collezionisti e studiosi, ma anche artisti e scultori. Già nel 1866 il conte Francesco Dolfin donò una medaglia in oro del papa Gregorio XIV e, in anni recenti, non possiamo non segnalare le cospicue donazioni degli eredi di Mariano Brugnera, di Vittorio Lorioli, studioso appassionato di medaglistica e impreditore attivo proprio nella produzione di medaglie, e degli eredi dello scultore e medaglista Luciano Mercante.